马耳他国际机场（MLA）是马耳他唯一的机场，是绝大部分国外游客的首要落脚地。机场以欧洲境内航班居多。
目前从国内没有直达马耳他的航空公司，转机航班也不多，如果是从国内直接前往马耳他，性价比不高，可操作度较低，但在欧洲境内有大量航空公司特别是很多廉航公司都经营从欧洲各大城市飞往马耳他的线路，因此建议将马耳他于其他欧洲景点连起来，组成一条欧洲大城市加海岛休闲游的完美行程。
马耳他机场有连接瓦莱塔市区和岛上其他地区的机场公交线路，这些线路大多以X开头，机场大厅有公交售票处。
马耳他有三个码头，其中位于首都瓦莱塔的大码头（Grand Habour）在夏季有船开往意大利的西西里岛和西班牙的瓦罗西亚。
