在东京市内，由于比较拥挤，所以利用巴士的人是很有限的，而与电车线路相互重合的线路基本上都用来观光。
连接银座与台场这些超人气景点的快速巴士每20-30分发车。此车由东京站出发，跨越彩虹大桥。由于采用座席定员制（45人），每位乘客都能坐着欣赏沿路美景。还有很多优惠，比如持有都营交通的一日乘车券则降价为100日元，乘车日若为生日则免费等等。
行车路线：东京站丸之内南口~银座4丁目~台场
营业时间：8:00~20:00 周六，周日及节假日期间为9:00开始。
车票：成人300日元；儿童150日元（乘车时付款）
乘车地点：
东京站乘车地：东京站丸之内南口旁（千代田区丸之内2-7附近）
银座4丁目乘车地：地铁银座站A6出口旁（中央区银座4-7附近）
台场乘车地：百合鸥线台场站旁
国际机场：国际机场是日本国际航班的枢纽。机场便于旅客利用的各种设施齐全，亦可充分享受购物和美食。
日本主要的国际机场是成田国际机场、位于名古屋近郊的中部国际机场以及位于大阪近郊的关西国际机场。从这三个机场出发，有很多搭乘方便的飞往日本国内各城市的飞机航班。
关西国际机场：关西国际机场地处大阪湾东南部，距离海岸5公里，JR新大阪站60公里。从关西国际机场出发的国际航班机票中包含机场使用费。
关西国际机场主要交通工具：JR西日本;南海电铁;机场巴士(关西空港交通株式会社)。
成田国际机场：成田国际机场位于东京都以东60公里。从成田国际机场出发的国际航班机票中包含机场使用费。成田国际机场主要交通工具：JR东日本；京成电铁；机场巴士（东京空港交通株式会社）。
中部国际机场：中部国际机场（新特丽亚）位于名古屋市以南35公里处。从中部国际机场出发的国际航班机票中包含机场使用费。此外，在本机场出发降落的各国内航班也需要支付机场使用费（机票内含）。
中部国际机场主要交通工具：名古屋铁道;机场巴士(名铁巴士株式会社)。
东京地下铁公司经营的地铁乘车基本费规定为6公里以内160円，随后依乘车距离递增为190日元，230円。都营地铁的票价稍贵，即4公里以内为170円，递增为210円，260円。如途中需在两公司的地铁之间转乘，可享受低于合计车费40円的优惠。
地铁换乘：如果是不同公司间的线路换乘时，一般需要走出检票口进入其他线路的车站换乘，但如果是东京METRO与都营地下铁之间的换乘是不需要走出检票口。
东京的票价一般如下：
1.营团地铁1日通用乘车券所有营团地铁710円；
2.都营一日通用经济乘车券都营地铁，都营公共汽车和都营荒川线700円；
3.营团都营通用乘车券地下铁成人1000円；
4.东京都内自由乘车券 JR730円；
日本计程车十分普遍，除了人口极端稀少的地区，不论在都市里还是在地方上，到处都能叫到计程车。机场、车站前的指定位置都停着许多计程车，乘坐十分方便。在其他地方也有许多计程车在街上行驶，只要举手招呼一下就会停下来。但费用有一些差别，东京的起步价是660日元，而后根据距离和时间来加收车费。夜间要加价。
东京的迪士标准计价方式为起程价格一般为660日圆（2公里以内），以后每行驶274米加收80下速度行驶时每1分40秒钟加收80日圆。晚23：00时至清晨05：00时间费用加收30％。迪士车内均安装有计程表，计价清晰明了。日圆，时速10公里∕小时以
到日本最为方便的交通工具是乘坐飞机。
日本主要的国际机场是成田国际机场和位于大阪近郊的关西国际机场。从这两个机场出发，有很多搭乘方便的飞往日本国内各城市的飞机航班。日本的航空公司——日本航空（JAL）、全日空（ANA）、日本 AIR SYSTEM（JAS）都有连接欧洲、亚洲和美洲各主要城市的庞大的航线网络。另外，世界各国的主要航空公司也有飞往日本各主要城市的飞机航班。
日本的铁路铁路总长4.7万公里，铁路中的新干线是长距离客运的主要交通手段，也是向外国旅客推荐的主要交通工具。新干线每隔十几分钟就有一班从东京开往国内各主要城市的列车，线路有东京至大阪间的东海道新干线、大阪至博多间的山阳新干线、大宫至盛冈间的东北新干线、大宫至新泻间的上越新干线和福岛至山形间的山形新干线等等。
此外，在日本的主要大城市中，地铁交织如网，遍布各处，较汽车更为迅捷、准时、方便。
日本的列车车票价格除了根据乘坐距离远近而不同之外，乘坐特快列车、快车等种类的列车和乘坐绿色列车(头等列车)、对号入座车、卧车等座席种类有所不同的列车时还要另外增加支付费用。
短途旅客的列车车票可以在各车站的自动售票机购买，而长途列车车票则要到车站内的“绿色窗口”处购买。
高速公路非常发达，以东京至小牧、小牧至西宫、吹田至下关的公路为首，东北纵贯、九州纵贯、北陆中央等都已全线贯通。此外，还有东京内的首都高速、连接各高速公路的外环高速等，每年都有新的高速公路建成。
日本有几家轮船公司开设有从国内主要港口通往俄罗斯、韩国和中国各港口城市的定期航班。尤其是从日本的福冈市和下关市到韩国，有轮渡和高速轮船在通航。
准备到日本来旅行的外国旅客必须事先在海外的日本旅行社代理店买好"周游券的兑换票"。
外国旅客到了日本以后，要去指定的日本国内换票处(JTB International、日本旅行、近畿日本Tourist、东急观光等的海外办事处以及跟上述这些旅行服务公司有合作关系的当地地方旅行社)，凭事先买好的"周游券的兑换票"，并出示盖有"临时逗留者"印章的护照，换取日本铁路周游券。
